Strefy kontrolowanego środowiska (ZAC) muszą być projektowane od samego początku jako narzędzia operacyjne, które gwarantują jakość i bezpieczeństwo wyrobów medycznych oraz substancji chemicznych. Należy dobierać materiały, które same nie emitują zanieczyszczeń, a także stosować gładkie i szczelne powłoki, które są łatwe do czyszczenia.
Pomieszczenia czyste muszą być wyposażone w systemy uzdatniania powietrza, których kluczowym elementem jest filtr HEPA (wysokowydajny filtr cząstek stałych), zdolny do wychwytywania cząstek o wielkości co najmniej 0,3 μm, a także filtr ULPA (filtr o ultra niskiej przepuszczalności cząstek), gdy wymagania są jeszcze bardziej rygorystyczne.
Systemy laminarnego przepływu powietrza również przyczyniają się do utrzymania równomiernego, stałego i jednokierunkowego przepływu powietrza. W pomieszczeniach czystych klasy A ich stosowanie jest obowiązkowe. Ponadto muszą być dostępne systemy dyfuzji powietrza, urządzenia do utrzymywania nadciśnienia lub podciśnienia, a także systemy mieszania powietrza (w celu recyrkulacji lub wyciągu).
Do monitorowania pomieszczeń o kontrolowanym środowisku konieczne jest stosowanie różnych przyrządów pomiarowych, takich jak: czujniki temperatury i wilgotności, czujniki tlenu i CO₂, przetworniki do wykrywania cząstek, rejestratory małych różnic ciśnień itp.