Płytka PYNQ-Z1 jest przeznaczona do stosowania z PYNQ, nową strukturą open source, która umożliwia jej zastosowanie Programiści, którzy wykorzystują możliwości Xilinx Zynq Wszystkich programowalnych układów SoC (APSoC) bez konieczności projektowania programowalne obwody logiczne. Zamiast tego APSoC jest programowany za pomocą Python, z kodem opracowanym i przetestowanym Bezpośrednio na PYNQ-Z1. Programowalne obwody logiczne są importowane jako biblioteki sprzętu i programowane Poprzez ich interfejsy API w zasadniczo taki sam sposób, jak biblioteki oprogramowania są importowane i programowane.